1. 單位簡介：國境事務大隊職司我國各機場、港口旅客入出國境之安全管理工作，駐點分布於松山、桃園、臺中、嘉義、臺南、高雄、臺東、花蓮、金門及澎湖等10座機場，以及基隆、臺北、臺中、麥寮、布袋、安平、高雄、花蓮、和平、蘇澳、澎湖馬公、金門水頭及料羅、馬祖福澳及白沙等15座港口。主要任務係執行旅客證照查驗，防止不法人士持用偽、變造及冒領或冒用護照非法偷渡，以維護國境安全
2. 國境資訊科技運用：建置「航前旅客資訊系統（Advance Passenger Information System, APIS）」與「航前旅客審查系統（Advance Passenger Processing System, APP）」，將國境防線延伸至航班抵達前，有效事前篩濾入、出及過境之管制對象，以供預作防範與處理。另自民國104年8月1日起於全國各主要入出境機場港口全面實施外來人口個人生物特徵（臉部特徵與指紋）之錄存及比對作業，以避免外來人口冒用他人身分入出國。復於105年1月4日啟用「偽變造護照辨識比對系統」，建立各國護照樣本庫，可協助比對護照細部防偽特徵、強化新進人員辨識偽變造護照能力
3. 國外旅客入境查驗：體驗移民官查驗入境旅客流程，為觀察旅客護照是否為真，移民官通常會使用放大鏡審視護照上有無偽、變造痕跡(亦可觸摸表面有無突起顆粒辨識)，再讓旅客按壓指紋 以辨識人別，輔以對照電腦螢幕左側之通緝犯圖像，過濾篩檢此人是否為通緝犯。如有餘力時，可觀察旅客在等候線至接近查驗台過程的臉部表情變化、肢體動作，揣測此人可能有盜用他人身分，才會有神情緊張的樣貌，加以研判是否為偷渡旅客。
4. 通緝犯或可疑人士拘留：防止不法人士持用假護照非法偷渡，以維護國境安全，對外來人口面談、訪查、查緝、收容及遣送業務。另依入出國及移民法第64條，檢察官於偵辦案件有需要拘提的嫌疑人在國外，而尚未發布通緝時，可以先請移民署於入境先行留置嫌疑人並通知承辦員警，再事先開拘票給承辦員警，一旦收到移民署通知說人犯已經入境留置，就由員警帶拘票將嫌疑人拘提回來，即為地檢署與移民署的合作。